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你了解多重PCR嗎?

發(fā)布時間:2025-01-17    瀏覽次數(shù):316

一、什么是多重PCR

多重PCR (Multiplex polymerase chain reaction,MPCR) 是是在普通PCR 技術的基礎上發(fā)展起來的,對于多重PCR 技術的原理,和PCR 技術大致相同,是加入兩對及以上的特異性引物在同一個PCR 反應體系中,而由于引物能夠特異性結合模板DNA,所以在同一模板不同區(qū)的多個目的或是多個模板的NDA 片段能夠擴增出來。對于多重PCR 技術,具有低成本、高效率、簡單省時等優(yōu)點,在其基于引物篩選的基礎上需要多次優(yōu)化反應體系和反應條件。

常規(guī)PCR與多重PCR

二、多重PCR反應分類:

1,單一模板PCR反應
該技術使用單一模板,該模板可以是基因組DNA,以及幾對正向和反向引物,以擴增模板內(nèi)的特定區(qū)域。

2,多模板PCR反應
它在同一反應管中使用多個模板和幾組引物。多個引物的存在可能導致彼此交叉雜交,并可能導致與其他模板錯誤引發(fā)。

多模板PCR反應

三、多重PCR的特點

同時檢測多個目標:可以在一個反應中同時擴增多個DNA序列,適用于檢測多個基因、病原體或突變。

需要優(yōu)化反應條件:多重PCR的反應條件較為復雜,通常需要對引物濃度、退火溫度等參數(shù)進行優(yōu)化,以確保所有目標的有效擴增。

可能出現(xiàn)非特異性擴增:多重PCR中的引物間相互作用可能導致非特異性擴增,因此在設計引物時需要仔細考慮它們之間的相互作用,并進行優(yōu)化。

采用熒光標記可以進行定量分析:多重PCR結合熒光探針的使用,可以進行實時定量PCR(qPCR),精確測量目標DNA的濃度。

四、多重PCR的優(yōu)點:

● 單個樣本獲得更多的信息
● 高通量(適用于同時檢測多個基因、病原體或突變的情況,適合大規(guī)模篩查,具有高通量優(yōu)勢)
● 節(jié)省樣本與試劑(傳統(tǒng)PCR每個反應只能擴增一個目標,需要多個反應管,而多重PCR可以在一個反應中同時進行多個目標的擴增,減少了樣本消耗和試劑浪費)
● 節(jié)省時間(與傳統(tǒng)培養(yǎng)方法相比)
● 靈活性強(可以根據(jù)需要設置不同的引物組合,滿足不同的實驗需求)
● 減少移液錯誤
● 多重擴增在同一體系中進行,減少單獨擴增污染的可能性

五、多重PCR的缺點:

● 引物相互作用:多重PCR中的多個引物可能會發(fā)生相互干擾,導致引物之間的競爭作用或擴增效率降低。這種情況可能需要優(yōu)化反應條件,如引物濃度、退火溫度等。
● 擴增效率不均:不同的引物可能擴增效率不同,導致某些目標序列的擴增效果差,可能需要對反應體系進行優(yōu)化,確保所有目標序列都能有效擴增。
● 復雜的實驗設計:設計一個高效的多重PCR實驗需要考慮多個因素,如引物設計、反應體系、引物特異性等,因此設計過程相對復雜。
● 靈敏度問題:如果目標DNA的濃度差異較大,某些目標可能由于競爭效應而擴增不良,影響靈敏度。

六、多重PCR的應用

臨床診斷:多重PCR廣泛應用于病原微生物的檢測,尤其是一些病毒、細菌的多重檢測,或者當臨床樣本難以收集或體積有限(如脊髓液),在單個樣本中檢測多個靶標的可能性尤為重要,這使得臨床醫(yī)生難以縮小致病病原體的范圍。

遺傳學研究:在遺傳學研究中,多重PCR可用于同時檢測多個基因突變、基因表達分析或基因多態(tài)性研究。

法醫(yī)鑒定:多重PCR在法醫(yī)科學中被廣泛應用,例如在親子鑒定中同時擴增多個短串聯(lián)重復序列(STR)進行個體身份識別,以及HLA檢測中會經(jīng)常用到。

食品安全:多重PCR可以用于檢測食品中的多種病原菌或轉基因成分,從而提高檢測效率和準確性。

環(huán)境監(jiān)測:在環(huán)境微生物監(jiān)測中,多重PCR可以同時檢測多個微生物種類,如水體或土壤中的病原微生物,幫助進行污染源追蹤。

癌癥研究:多重PCR可用于癌癥相關基因的檢測,尤其是在早期篩查中,用于識別多個腫瘤標志基因。

文章來源:環(huán)凱(官網(wǎng):huankai.com)轉載于“ Gene Diagnosis”公眾號;原作者~ gene diagnosis。
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