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全基因組測序驗證RT-qPCR結(jié)果:冷凍漿果中食源性病毒檢測新進展

發(fā)布時間:2024-09-20      瀏覽次數(shù):5    分享:

科技前沿

在食品安全領(lǐng)域,病毒檢測技術(shù)的準確性與可靠性一直是科研人員關(guān)注的焦點。近期,一項結(jié)合了全基因組測序與RT-qPCR技術(shù)的新型病毒檢測方法,為冷凍漿果中的食源性病毒檢測提供了更精準的解決方案。這一方法不僅提升了檢測的靈敏度,還能夠?qū)Σ《具M行全基因組分析,為病毒的溯源與防控提供了強有力的技術(shù)支撐。

技術(shù)解析

全基因組測序(Whole-Genome Sequencing,WGS)作為一種高通量測序技術(shù),能夠?qū)悠分械牟《净蚪M進行深度測序。與傳統(tǒng)的RT-qPCR(實時定量聚合酶鏈式反應(yīng))相比,WGS能夠提供病毒的全基因組信息,這對于病毒的分類、進化分析以及新病毒的發(fā)現(xiàn)具有不可替代的優(yōu)勢。通過與RT-qPCR結(jié)果的結(jié)合,WGS能夠?qū)Τ醪綑z測到的病毒進行確認,確保檢測結(jié)果的準確性。

應(yīng)用案例

在一項針對冷凍漿果的檢測中,科研人員首先利用RT-qPCR快速篩查出可能含有食源性病毒的樣品。隨后,采用WGS對RT-qPCR檢測出陽性的冷凍漿果樣本進行深度測序。通過比對已知病毒基因組,不僅確認了RT-qPCR結(jié)果的準確性,還進一步分析了病毒的基因型和變異情況,為后續(xù)的病毒防控提供了重要信息。

樣品制備、RNA分離、PCR檢測和全基因組測序的實驗方法示意圖

圖1 樣品制備、RNA分離、PCR檢測和全基因組測序的實驗方法示意圖

技術(shù)優(yōu)勢

相較于傳統(tǒng)的單一RT-qPCR檢測方法,全基因組測序與RT-qPCR結(jié)合的方法具有以下優(yōu)勢:
高靈敏度與特異性:RT-qPCR的快速篩查結(jié)合WGS的深度分析,確保了檢測結(jié)果的準確性。
全基因組信息:WGS能夠提供病毒的全基因組序列信息,為病毒的分類與溯源提供了可能。
適應(yīng)性廣泛:這一方法不僅適用于冷凍漿果,對于其他食品中的病毒檢測同樣有效。

結(jié)語

科技的進步不斷推動著食品安全檢測技術(shù)的革新。全基因組測序與RT-qPCR結(jié)合的方法,不僅為冷凍漿果中的食源性病毒檢測提供了更精準的解決方案,也為其他食品病毒檢測開辟了新的道路。未來,隨著技術(shù)的不斷成熟與應(yīng)用,食品安全將得到更有力的保障,公眾健康也將得到更全面的保護。

參考文獻:Whole-Genome Sequencing-Based Confirmatory Methods on RT-qPCR Results for the Detection of Foodborne Viruses in Frozen Berries

來源:微生物安全與健康網(wǎng),作者~蔡偉程。